Analysis of VRTN, NR6A1 and LTBP2 gene polymorphisms in Lijiang pigs and their association with the number of thoracic vertebrae
Notice bibliographique
Résumé
To explore the polymorphisms of the VRTN, NR6A1, and LTBP2 genes and their association with thoracic vertebrae count in Lijiang pigs, genotyping these genes’ exons and the VRTN promoter region was conducted in 205 individuals. Polymerase chain reaction (PCR) and Sanger sequencing were used for this purpose. Genotype and allele frequencies of the identified variants were calculated, and their associations with thoracic vertebrae count were analyzed. A total of eight missense mutations and one insertion mutation were identified. Moderate polymorphism was detected in VRTN (g.97622607G>A, g.97623006G>A, g.97623046C>T), NR6A1 (g.265347265T>C), and LTBP2 (SSC7:97765472C>G), while VRTN (g.976158896_976158897ins291) and LTBP2 (SSC7:97770379T>C) showed low polymorphism. Importantly, the VRTN variant g.976158896_976158897ins291 and the LTBP2 variant SSC7:97770379T>C were significantly associated with thoracic vertebrae count (P<0.01). Further, the NR6A1 variant g.265347265T>C was also significantly associated with thoracic vertebrae count (P<0.05). The variants g.976158896_976158897ins291 of VRTN, g.265347265T>C of NR6A1, andSSC7:97770379T>C of LTBP2 significantly influence the number of thoracic vertebrae, providing valuable insights for the molecular breeding of Lijiang pigs concerning this trait.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».