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Enregistrement W4407937198 · doi:10.1139/cjas-2024-0102

Analysis of VRTN, NR6A1 and LTBP2 gene polymorphisms in Lijiang pigs and their association with the number of thoracic vertebrae

2025· article· en· W4407937198 sur OpenAlexvenueno aff
Xinxing Dong, Jie Duan, Guoxiang Lan, Dawei Yan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Animal Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneThoracic vertebraeGeneticsBiologyAssociation (psychology)MedicineAnatomyLumbar vertebraePsychologyLumbar

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To explore the polymorphisms of the VRTN, NR6A1, and LTBP2 genes and their association with thoracic vertebrae count in Lijiang pigs, genotyping these genes’ exons and the VRTN promoter region was conducted in 205 individuals. Polymerase chain reaction (PCR) and Sanger sequencing were used for this purpose. Genotype and allele frequencies of the identified variants were calculated, and their associations with thoracic vertebrae count were analyzed. A total of eight missense mutations and one insertion mutation were identified. Moderate polymorphism was detected in VRTN (g.97622607G>A, g.97623006G>A, g.97623046C>T), NR6A1 (g.265347265T>C), and LTBP2 (SSC7:97765472C>G), while VRTN (g.976158896_976158897ins291) and LTBP2 (SSC7:97770379T>C) showed low polymorphism. Importantly, the VRTN variant g.976158896_976158897ins291 and the LTBP2 variant SSC7:97770379T>C were significantly associated with thoracic vertebrae count (P<0.01). Further, the NR6A1 variant g.265347265T>C was also significantly associated with thoracic vertebrae count (P<0.05). The variants g.976158896_976158897ins291 of VRTN, g.265347265T>C of NR6A1, andSSC7:97770379T>C of LTBP2 significantly influence the number of thoracic vertebrae, providing valuable insights for the molecular breeding of Lijiang pigs concerning this trait.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,511
Score d'incertitude au seuil0,307

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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