De novo missense variants in the RPEL3 domain of PHACTR4 in individuals with overlapping congenital anomalies
Notice bibliographique
Résumé
PHACTR4 is proposed to play a role in embryonic development but has yet to be associated with human disease. Here, we report the detailed clinical features of two individuals for whom molecular diagnostic testing was undertaken at a large diagnostic laboratory and who were found to harbor rare, damaging de novo missense variants in the conserved RPEL3 domain of PHACTR4. We also present aggregate information on additional individuals in whom missense variants in the same PHACTR4 gene region were detected. All presented with overlapping phenotypes. Features present in at least half of these individuals included cleft palate, ophthalmologic abnormalities, hearing impairment, dysmorphic facial features, digital anomalies, renal/urinary anomalies, growth delay, microcephaly, abnormal brain imaging, and neurodevelopmental abnormalities; some individuals had additional unique findings as well. The proposed cellular function of PHACTR4 and information from related genes with variants in an RPEL domain suggest that PHACTR4 is a promising candidate gene for human disease. We hope that this report will promote additional research interest in the PHACTR4 gene and lead to the publication of additional cases, to potentially establish a causative relationship and to further delineate the phenotypic and variant spectrum of a PHACTR4-related disorder.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».