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Enregistrement W4407979788 · doi:10.1007/s00572-025-01187-7

Enhancing consistency in arbuscular mycorrhizal trait-based research to improve predictions of function

2025· review· en· W4407979788 sur OpenAlexafffund
Pedro M. Antunes, Sidney Luiz Stürmer, James D. Bever, Pierre‐Luc Chagnon, V. Bala Chaudhary, Coline Deveautour, Catherine Fahey, Vasilis Kokkoris, Ylva Lekberg, Jeff R. Powell, Carlos A. Aguilar‐Trigueros, Haiyang Zhang

Notice bibliographique

RevueMycorrhiza · 2025
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensUniversité de MontréalAlgoma University
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsNational Science Foundation
Mots-clésBiologyTraitArbuscular mycorrhizal fungiConsistency (knowledge bases)Mycorrhizal fungiFunction (biology)MycorrhizaBotanySymbiosisBiotechnologyHorticultureEvolutionary biologyGeneticsBacteriaMathematicsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Arbuscular mycorrhizal (AM) fungi (phylum Glomeromycota) are obligate symbionts with plants influencing plant health, soil a(biotic) processes, and ecosystem functioning. Despite advancements in molecular techniques, understanding the role of AM fungal communities on a(biotic) processes based on AM fungal taxonomy remains challenging. This review advocates for a standardized trait-based framework to elucidate the life-history traits of AM fungi, focusing on their roles in three dimensions: host plants, soil, and AM fungal ecology. We define morphological, physiological, and genetic key traits, explore their functional roles and propose methodologies for their consistent measurement, enabling cross-study comparisons towards improved predictability of ecological function. We aim for this review to lay the groundwork for establishing a baseline of AM fungal trait responses under varying environmental conditions. Furthermore, we emphasize the need to include underrepresented taxa in research and utilize advances in machine learning and microphotography for data standardization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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