Downregulation of the Unfolded Protein Response Links Metformin Treatment to Good Clinical Outcomes in Colorectal Cancer Patients
Notice bibliographique
Résumé
Type 2 diabetes is a risk factor for colorectal cancer (CRC) development and progression. However, metformin-treated diabetic CRC patients tend to have better clinical outcomes than those managed by other means. To better characterize the molecular underpinnings of metformin’s protective effects, we performed a targeted transcriptomic analysis of primary CRC tissue samples (n = 272). A supervised learning algorithm pinpointed molecular features that discriminate between metformin-treated and diet-controlled diabetic CRC samples, as well as those that discriminated between non-diabetic samples based on their five-year overall survival status. Our results show downregulation of TMEM132 in metformin-treated samples (p = 0.05) and non-diabetics with good clinical outcomes (p = 0.05) relative to diet-controlled and non-diabetics with poor survival, respectively. Furthermore, upregulation of SCNN1A is observed in metformin-treated samples (p = 0.04) and non-diabetics with good clinical outcomes (p = 0.01) relative to diet-controlled samples and those with poor clinical outcomes, respectively. We also show that the antiapoptotic protein sFas is downregulated in metformin-treated samples relative to diet-controlled samples (p = 0.005). These findings suggest a role for the unfolded protein response in mediating metformin-related CRC-protective effects by enhancing apoptosis and suggest the investigation of these proteins as targets for novel CRC therapies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».