MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4408070579 · doi:10.1111/1462-2920.70067

Genetic Diversity and Anatoxin Profiles of Freshwater Benthic Cyanobacteria From Nova Scotia (Canada)

2025· article· en· W4408070579 sur OpenAlexafffundabout
Cecilio Valadez‐Cano, Nicolas Tromas, Adrián Reyes‐Prieto, Lindsay Johnston, Yannan Huang, Hannah Morris, Lydia Zamlynny, Daniel G. Beach, Rob Jamieson, Janice Lawrence

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Établissements canadiensNational Research Council CanadaDalhousie UniversityUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyLake ecosystemCyanobacteriaBenthic zoneEcologyRiver ecosystemSpecies richnessGenetic diversityEcosystemGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Some mat-forming cyanobacteria produce harmful cyanotoxins, yet benthic species remain understudied compared to planktonic counterparts. This study assesses the diversity, distribution and toxin production of mat-forming cyanobacteria across lentic and lotic systems in Nova Scotia, Canada. We documented greater cyanobacterial species richness in lentic environments, with six dominant species distributed into two major Microcoleus clades, five of which represent putative novel taxa. Two Microcoleus species with the genetic repertoire to produce anatoxins were prevalent. One has been previously reported in Canada, while the second represents a novel species found exclusively in an environment impacted by discharge from a water treatment plant. We observed variability in the gene clusters responsible for the biosynthesis of anatoxin-a and associated analogues (ATXs), including the discovery of a novel anaG variant with a ~ 1.7 kb insertion in a Microcoleus strain dominating homoanatoxin-producing mats. This extended anaG, encoding a polyketide synthase with an additional methyltransferase domain, coexists with shorter variants, leading to the production of a mixture of ATXs. These findings highlight the genetic diversity of benthic cyanobacteria in freshwater environments, with Microcoleus as the primary contributor to the production of ATXs in both lentic and lotic systems, underscoring their potential to produce harmful toxins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,310
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,166
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEnvironmental MicrobiologyMême sujetAquatic Ecosystems and Phytoplankton DynamicsTravaux en français237 207