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Enregistrement W4408078771 · doi:10.18502/igj.v8i2.18003

Associations of TNF-Α -308 and -238 Polymorphisms with Inflammatory Bowel Disease: A Case-Control Study and Meta-Analysis of Published Data

2025· article· en· W4408078771 sur OpenAlexaff
Aaron Shanker, Maryam Sadr, Samaneh Soltani, Sepideh Shahkarami, Elham Farhadi, Nasser Ebrahimi Daryani, Behnoud Baradaran Noveiry, Farnaz Najmi Varzaneh, Mohammad Bashashati, Nima Rezaei

Notice bibliographique

RevueImmunology and Genetics Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInflammatory bowel diseaseMeta-analysisMedicineTumor necrosis factor alphaInternal medicineDiseaseImmunologyGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Inflammatory bowel disease (IBD) is a chronic relapsing-remitting inflammatory disease of the intestinal tract. Tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) signaling plays a major role in the pathogenesis of IBD and is commonly targeted for therapeutic purposes. Results on the contribution of TNF-α -308 and -238 single nucleotide polymorphisms (SNP) to the susceptibility to IBD have been contradictory in differ- ent populations. Methods: Allele frequency and genotype status of TNF-α -308 and -238 SNPs were investigated in 75 un- related patients with IBD [40 Crohn’s disease (CD) and 35 ulcerative colitis (UC)] and 140 healthy controls by polymerase chain reaction with sequence-specific primers (PCR-SSP). We also conducted a systematic review and meta-analysis of the published reports. Results: TNF-α -238 GG was detected at a higher frequency in CD and UC. TNF-α -308 GG was more frequently detected in UC compared to control. There was no significant association between TNF-α -238 or -308 gene polymorphisms and patients’ demography (i.e., gender and age) or disease phenotype (i.e., extraintestinal manifestations, treatment, activity index, age at onset, and duration of the disease). In the meta-analysis, TNF-α -238 (AA/AG) genotype tended to be less frequent in patients with UC compared to healthy controls. There was no association between TNF-α -238 gene polymorphisms (AA/AG or GG genotypes) and either form of IBD. Conclusion: TNF-α -308 and -238 SNPs are associated with IBD in Iranian patients. TNF-α -308 AA gen- otype is positively correlated with UC in this meta-analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,053

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0120,027
Bibliométrie0,0050,009
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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