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Enregistrement W4408087403 · doi:10.1101/2025.02.26.640352

Hallmarks and metabolic regulation of type 2 activated human lung macrophages

2025· preprint· en· W4408087403 sur OpenAlexaff
Amanda J. L. Ridley, Annabel J. Curle, Stefano A. P. Colombo, Douglas P. Dyer, Angela Simpson, Maria Feeney, Peter C. Cook, Andrew S. MacDonald

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLungMacrophageHuman lungCell biologyBiologyMedicineInternal medicineGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Although human lung macrophages are heterogenous and play key roles during health and disease, the mechanisms that govern their activation and function are unclear, particularly in type 2 settings. Our understanding of how human lung macrophages respond to inflammatory signals have predominantly relied on cell lines or peripheral blood derived cells, which have a limited capacity to reflect the complexity of tissue macrophage responses. Therefore, we isolated macrophages from resected human lung tissue and stimulated them ex vivo under type 2 (IL-4, IL-13, or IL-4 + IL-13) or type 1 (IFNγ + LPS) conditions. Human lung macrophages stimulated with IL-4/13, alone or in combination, significantly upregulated expression of the chemokines CCL17 , CCL18 and CCL22, along with the transglutaminase TGM2 and the lipoxygenase ALOX15 . This type 2 activation profile was distinct from LPS + IFNγ activated human lung macrophages, which upregulated IL6 , IL8 , IL1β , TNFα and CHI3L1 (YKL-40). Further, type 2 activated human lung macrophage products showed differential metabolic reliance for their induction, with IL-4/13 induced CCL22 being glycolytically controlled, while ALOX15 was regulated by fatty acid oxidation. These data clarify hallmarks of human lung macrophage activation and polarisation in addition to revealing novel metabolic regulation of type 2 markers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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