A Polygenic Risk Score for Late Bladder Toxicity Following Radiotherapy for Non-Metastatic Prostate Cancer
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Late bladder toxicity is a concern for patients receiving prostate cancer radiotherapy and negatively affects survivors. Few risk factors are known beyond the radiation dose and volume of bladder exposed. A polygenic risk score (PRS) could identify susceptible patients. METHODS: A PRS was built using genome-wide association results from the Radiogenomics Consortium (N = 3,988) and then tested in the prospective REQUITE and URWCI studies (N = 2,034). The primary outcome was time to patient-reported gross [grade ≥2, (≥G2)] hematuria, analyzed using Cox proportional hazards regression. Secondary outcomes were ≥G2 urinary retention and frequency. The PRS was externally validated for clinically diagnosed irradiation cystitis in the UK Biobank (N = 8,430). A gene-burden test evaluated rare coding variants. RESULTS: A 115-variant PRS was associated with a significantly increased risk of ≥G2 hematuria [hazard ratio (HR) per SD = 1.22; P = 0.009] as well as urinary retention (HR per SD = 1.18; P = 0.016) and frequency (HR per SD = 1.14; P = 0.036). When binarized, men in the upper decile (PRShigh) had a >2-fold increased risk of hematuria after adjusting for clinical risk factors [HR = 2.12; P = 0.002; Harrel's concordance index = 0.71 (95% confidence interval, 0.65-0.76)]. A similar effect size was seen in the UK Biobank for clinically diagnosed irradiation cystitis [odds ratio (OR) = 2.15; P = 0.026]. The burden test identified BOD1L1 as a putative novel radiosensitivity gene. CONCLUSIONS: This PRS identifies susceptible patients and could guide the selection of those needing reoptimized treatment plans that spare the bladder beyond currently recommended constraints. IMPACT: PRS-guided treatment planning in radiation oncology could lower the incidence of clinically relevant bladder toxicity and reduce the impact of this outcome on prostate cancer survivors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».