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Enregistrement W4408118805 · doi:10.1186/s13073-025-01440-w

Non-coding cis-regulatory variants in HK1 cause congenital hyperinsulinism with variable disease severity

2025· article· en· W4408118805 sur OpenAlexaff
Cécile Saint‐Martin, Bianca Neumann, Jonna M. E. Männistö, Jayne Houghton, Susann Empting, Matthew B. Johnson, Thomas W. Laver, Jonathan M. Locke, Benjamin Spurrier, Matthew N. Wakeling, Indraneel Banerjee, Antonia Dastamani, Hüseyin Demirbilek, John Mitchell, M Stange, Marie‐Thérèse Abi Wardé, Mehta Amrita, Romy Aravena, Alina Arion, Navoda Atapattu, Ivo Barić, Jérôme Bertherat, Esra Bilici, Juliette Bouchereau, Karine Braun, Marie-Neige Campas-Lebecque, Mireille Castanet, Catie Cessans, Louise S. Conwell, Preeti Dabadghao, Archana Arya, Pascale de Lonlay, Céline Droumaguet, Noémie Faure-Galon, O. Gilly, Alice Goldenberg, Anne‐Sophie Guémann, Anne‐Marie Guerrot, Julie Harvengt, Samar S. Hassan, Saw Shi Hui, Khadija Nuzhat Humayun, M Ibrahim, Vandana Jain, Dhivyalakshmi Jeevarathnam, Kah Yin Loke, Vaman Khadilkar, I. P. S. Kochar, Abhishek Kulkarni, Aniket Kumbhojkar, Delphine Lamireau, Floris Levy‐Khademi, Catarina Limbert, Martin Lindner, Catherine Lombard, F. Maillot, Karine Mention, Verónica Mericq, Zainaba Mohamed, Coline Mornet, Philip Murray, Alexandre Naccache, Lusine Navasardyan, Kristen Neville, Ramona Nicolescu, Marc Nicolino, Elisa Nishimura‐Meguro, Nattakarn Numsriskulrat, S. S. O'Sullivan, Yasmine Ouarezki, Armelle Pambou, Florence Petit, V. P. Praveen, Mélanie Priou-Guesdon, Birgit Rami‐Merhar, Sudha Rao, Yves Reznik, Laurence Rulquin, Maria Salomon Estebanez, Isabelle Souto, Antoine Tabarin, Ana Tangari, Sara Van Aken, Charles F. Verge, Hélène Vinolas, Christel Voinot, Robert R. Wagner, Jan L Walker, Esko Wiltshire, Klaus Mohnike, Jean‐Baptiste Arnoux, Nick Owens, Martin Zenker, Christine Bellanné-Chantelot, Sarah E. Flanagan

Notice bibliographique

RevueGenome Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHyperglycemia and glycemic control in critically ill and hospitalized patients
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesWellcome TrustWellcome
Mots-clésHyperinsulinismCongenital hyperinsulinismProbandMedicineCohortHyperinsulinemic hypoglycemiaHyperinsulinemiaDiseaseHypoglycemiaInternal medicineGeneticsBioinformaticsBiologyInsulinMutationGeneInsulin resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: We recently reported non-coding variants in a cis-regulatory element of the beta-cell disallowed gene hexokinase 1 (HK1) as a novel cause of congenital hyperinsulinism. These variants lead to a loss of repression of HK1 in pancreatic beta-cells, causing insulin secretion during hypoglycaemia. In this study, we aimed to determine the prevalence, genetics, and phenotype of HK1-hyperinsulinism by screening a large international cohort of patients living with the condition. METHODS: We screened the HK1 cis-regulatory region in 1761 probands with hyperinsulinism of unknown aetiology who had been referred to one of three large European genomics laboratories. RESULTS: We identified a HK1 variant in 89/1761 probands (5%) and 63 family members. Within the Exeter HI cohort, these variants accounted for 2.8% of all positive genetic diagnoses (n = 54/1913) establishing this as an important cause of HI. Individuals with a disease-causing variant were diagnosed with hyperinsulinism between birth and 26 years (median: 7 days) with variable response to treatment; 80% were medically managed and 20% underwent pancreatic surgery due to poor response to medical therapy. Glycaemic outcomes varied from spontaneous remission to hypoglycaemia persisting into adulthood. Eight probands had inherited the variant from a parent not reported to have hyperinsulinism (median current age: 39 years), confirming variable penetrance. Two of the 23 novel HK1 variants allowed us to extend the minimal cis-regulatory region from 42 to 46 bp. CONCLUSIONS: Non-coding variants within the HK1 cis-regulatory region cause hyperinsulinism of variable severity ranging from neonatal-onset, treatment-resistant disease to being asymptomatic into adulthood. Discovering variants in 89 families confirms HK1 as a major cause of hyperinsulinism and highlights the important role of the non-coding genome in human monogenic disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,094
Score d'incertitude au seuil0,990

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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