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Enregistrement W4408131637 · doi:10.1101/2025.02.28.640839

Small Molecule Disruption of a Protein Disulfide Isomerase-Containing Multi-Protein Complex Causes Broad Cancer Selective Metabolic Collapse and Tumor Inhibition <i>in vivo</i>

2025· preprint· en· W4408131637 sur OpenAlexaff
Anuradha F. Lingappa, Suguna Mallesh, Maya Michon, D. SHIVARUDRASWAMY, Jim Jung‐Ching Lin, M. Dharma Prasad, Debendranath Dey, Dennis Solas, Vishwanath R. Lingappa

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCytotoxicitySmall moleculeSeries (stratigraphy)ChemistryMoleculeStructure–activity relationshipCombinatorial chemistryComputational biologyStereochemistryCancer researchBiochemistryBiologyIn vitroOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract PAV-620, and PAV-805 are chemical analogs from a protein assembly modulating small molecule lead series that displays broad anti-cancer activity. These compounds are active against all cancers in the NCI-60 cancer cell line screen, which is representative of diverse blood, brain, breast, colon, lung, ovarian, prostate, renal, and skin cancers. Safety in mice is observed up to doses of 10 mg/kg daily and nontoxicity to healthy human peripheral blood mononuclear cells at doses up to 20uM. The compounds are as efficacious as Paclitaxel in reducing tumor growth and metastasis in the aggressive 4T1 mouse allograft model for triple negative breast cancer. The mechanism of action of PAV-620 and PAV-805 in primary carcinoma cells under conditions inducing programmed cell death was found to be distinct from the cytotoxic mechanisms of Staurosporine, Paclitaxel, and Etoposide. PAV-805 was shown to target a small subset of protein disulfide isomerase (PDI) in a dynamic multi-protein complex enriched in the cancer hallmark proteins involved in reprogramming energy metabolism. These data suggest a new approach to cancer therapeutics, with selectivity arising not from targeting PDI itself, an abundant cellular protein, but from targeting a disease-associated assembly state of PDI-containing complexes as a therapeutically exploitable dimension of cancer biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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