Cell-free DNA in ex-vivo lung perfusate is associated with low-quality lungs and lung transplant outcome
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Cell-free DNA (cfDNA) in ex-vivo lung perfusion (EVLP) perfusate has been shown to potentially reflect lung injury; however, the relationship between cfDNA concentration with clinical EVLP lung outcomes has not been elucidated. METHODS: A discovery cohort of n = 100 clinical EVLP cases and a validation cohort (n = 50) were used in this single-center, retrospective cohort study. cfDNA was extracted and quantified from perfusate samples. The concentration of cfDNA at 1 hour and the change in cfDNA concentration per hour of EVLP in the transplanted and declined groups were compared by univariable and multivariable logistic regression. cfDNA was introduced as an additional factor in a machine-learning algorithm to predict lung utilization and postoperative outcome and the performance evaluated. RESULTS: Significantly higher cfDNA concentrations were observed in the declined group than in the transplanted group (1 hour: p < 0.001; delta/hour: p = 0.031). Multivariable analysis among the 1 hour factors showed that [cfDNA 1 hour] (OR 4.27, p = 0.010) was an independent prognostic factor. Increases in [cfDNA 1 hour], [cfDNA delta/hour], and both showed that both initial [cfDNA] and increases in [cfDNA] over time were independently correlated with the probability of a lung being declined. The validation analysis also confirmed higher [cfDNA 1 hour] in the declined group than in the transplanted group (p = 0.010). Addition of [cfDNA] features improved the performance of a machine-learning algorithm used to predict donor lung utilization. CONCLUSIONS: The cfDNA concentration in EVLP perfusate correlates with the rate of decline of lungs for transplant from EVLP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».