Impact of rs3077 (HLA-DPA1 gene) on chronic hepatitis B virus carriage in Cotonou
Notice bibliographique
Résumé
Hepatitis B Virus (HBV) is a major global health concern, particularly in sub-Saharan Africa, where infection rates are notably high. Despite this, data on the host genetic contributors to HBV infection, such as the single nucleotide polymorphism rs3077 (HLA-DPA1 gene), are unavailable in this region. To contribute to closing this gap, the present study explored the association between rs3077 and chronic hepatitis B virus (HBV) carriage. We used a cross-sectional study design, incorporating both descriptive analyses of chronic HBV carriers and analytical assays for rs3077 genotyping. The study included 48 melanoderma subjects with chronic HBV from the hepato-gastroenterology department of CNHU Hospital. These were matched by age and sex with 49 HBV-negative control subjects, selected from blood donors at the Atlantic-Littoral section of the Blood Donor Agency (ANTS). Both cases and controls underwent RT-PCR genotyping. The average age of chronic HBV carriers was 41.21±12.34 years, with the most prevalent age group being 31 to 43 years, accounting for 33.33% of the population. Considering potential transmission modes, the T allele was identified as a protective factor in the dominant model (Odds Ratio [OR] 0.046; 95% Confidence Interval [CI] 0.005 - 0.136). Conversely, the C allele was found to be a risk factor in both recessive (OR 47.162; 95% CI 6.754 - 203.063) and codominant models (OR 49.782; 95% CI 7.218 - 213.609). This study reveals that the C and T alleles of rs3077 have distinct roles in chronic hepatitis B virus carriage among individuals in Cotonou. Specifically, the C allele seems to be a risk factor, while the T allele appears to confer a protective effect. This finding emphasizes the importance of host genetic variation in HBV susceptibility and provides valuable insights for future research and potential targeted healthcare strategies in regions with high HBV prevalence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».