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Enregistrement W4408229979 · doi:10.1101/2025.03.06.25323462

Quantitative Measurements of α-Synuclein Seeds in CSF Inform Diagnosis of Synucleinopathies

2025· preprint· en· W4408229979 sur OpenAlexaff
Ilham Y. Abdi, Indulekha P. Sudhakaran, Simona S. Ghanem, Nishant N. Vaikath, Nour K. Majbour, Nirosen Vijiaratnam, Christine Girges, Vasilios C. Constantinides, Elisabeth Kapaki, George P. Paraskevas, Sandrina Weber, Gholam Adeli, Kostas Vekrellis, Daniel Erskine, Thomas Foltynie, Henry Houlden, Laura Parkkinen, Wilma D. J. van de Berg, Michael G. Schlossmacher, Omar El-Agnaf

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesQatar Biomedical Research Institute, Hamad Bin Khalifa UniversityQatar National Research FundFonds National de la Recherche LuxembourgSlovak Academic Information Agency
Mots-clésSynucleinopathiesNeuroscienceMedicinePsychologyAlpha-synucleinPathologyParkinson's diseaseDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Diagnosing α-synucleinopathies and assessing target engagement in trials is hindered by the lack of reliable biomarkers. Here, we introduce a first-in-kind quantitative, highly sensitive, and disease-specific diagnostic assay, named Seeding Amplification ImmunoAssay (SAIA), developed and validated to detect synucleinopathy-linked disorders. To this end, we used wide range of specimens, including 37 brain homogenates (BH) and 559 cerebrospinal fluid (CSF) samples from subjects with diverse synucleinopathy disorders, non-synucleinopathy diseases, idiopathic REM sleep behavior disorder (iRBD), and controls. SAIA generated robust amplification results detecting disease-related α-synuclein seeds in BH samples at attogram levels, as referenced to preformed fibrils of α-synuclein. Furthermore, we conducted side-by-side comparisons between SAIA and a traditional Seeding Amplification Assay (SAA), which revealed high concordance. Further, SAIA distinguished synucleinopathies from non-synucleinopathies and controls with sensitivities and specificities ranging between 80-100% and area under the curve values exceeding 0.9. SAIA also accurately identified 24/24 (100%) iRBD cases, considered a prodromal state of PD, with 100% sensitivity and 80% specificity. Further optimization of SAIA through timepoint analyses revealed that shorter incubation times enhanced the assay’s specificity for distinguishing MSA from PD highlighting the potential for improved differentiation between specific synucleinopathies. In conclusion, SAIA represents a novel powerful high throughput method to screen, diagnose and monitor synucleinopathy disorders in living subjects, offering significant improvements over existing methods to assist clinical trials that aim to test disease modifying interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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