Cohort-level clinical trajectory and molecular landscape of idiopathic subglottic stenosis for precision laryngology—a study of the Canadian Airways Research (CARE) group
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: First described in 1972, idiopathic subglottic stenosis (iSGS) is a serious chronic orphan disease characterised by recurrent scarring of the subglottis. Although the cause is unknown, iSGS is almost exclusively restricted to Caucasian females typically in their fourth to sixth decade. However, given its rare incidence (1:400,000), understanding the clinical trajectory and molecular factors associated with iSGS disease development and prognosis has been difficult. In the current study we sought to unravel the pathogenesis of iSGS at the clinical, transcriptional, and genetic level in a prospective cohort. METHODS: We prospectively enrolled 126 patients with iSGS, 104 controls, and 13 patients with traumatic SGS. Within this cohort, we profiled 114 human epiglottis and 121 human subglottis biopsies across three different conditions: control, iSGS, and intubation-related traumatic stenosis using bulk and single nucleus RNA-sequencing. Whole exome sequencing for germline variants was performed for 70 controls and 75 patients with iSGS. FINDINGS: Patients with iSGS received a median number of five (range 0-18) surgical dilations at a rate of 1.031 dilations (range: 0.12-6.2) per year. Older age at diagnosis and higher Cotton-Myers grade were associated with increased number of surgical dilations over time. Cohort-level bulk transcriptomics found that iSGS pathology was restricted within the subglottis and did not affect anatomically adjacent epiglottis, opposite to previous hypotheses. We further identified cellular subsets associated with iSGS prognosis and severity. Finally, patients with iSGS exhibit lower testosterone predicted using a polygenic score. INTERPRETATION: Together, our data refines our understanding of laryngeal biology and provides insights into the clinical trajectory of subglottic stenoses. Future research should explore the role of testosterone in the development of iSGS. FUNDING: This study was funded by a grant from the American Laryngology Association (#1082), an Academic Medical Organization of Southwestern Ontario innovation fund grant (INN21-016), grant support from the Departments of Otolaryngology-Head and Neck Surgery at University of Toronto and Western University. ACN was supported by the Wolfe Surgical Research Professorship in the Biology of Head and Neck Cancers Fund. PYFZ was supported by a Vanier Canada Graduate Scholarship and PSI foundation fellowship.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».