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Enregistrement W4408244549 · doi:10.7589/jwd-d-24-00091

DIAGNOSTIC STRATEGIES AND STRAIN TYPING FOR JOHNE'S DISEASE IN WOOD BISON (BISON BISON ATHABASCAE)

2025· article· en· W4408244549 sur OpenAlexaffabout
Ana Hernandez-Reyes, Jeroen De Buck, Jennifer Davies, Razieh Eshraghisamani, Larissa Martins, Karin Orsel

Notice bibliographique

RevueJournal of Wildlife Diseases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBison bisonMycobacterium avium subspecies paratuberculosisBiologyParatuberculosisHistopathologyVeterinary medicineEnteritisHerdCullingPathologyOutbreakMycobacteriumMicrobiologyVirologyBacteriaMedicineAnimal scienceEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cattle diseases are considered a major threat to wood bison (Bison bison athabascae) conservation. Johne's disease (JD) is a chronic infectious enteritis caused by Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (Map), that affects domestic and wild ruminants globally and could negatively impact wood bison health. Clinical manifestation of JD in free-ranging or captive wood bison has not been documented. We studied animals in a captive wood bison herd in Alberta, Canada 1) to detect Map in bison clinically suspected of Johne's disease, by histopathology, quantitative PCR (qPCR), and isolation by culture; 2) to identify optimal tissue samples for Map detection; and 3) to identify the strain(s) of Map isolated. Six wood bison were evaluated with clinical signs suggestive of JD. We performed necropsies within 24-48 h after euthanasia and collected 24 tissue samples from each bison. At necropsy, no evidence of thickening or corrugation of the intestinal mucosa was observed in any bison. On histopathologic examination, granulomatous lesions with acid-fast bacilli were more frequent in the paracortex of the midjejunal lymph node (LN) and distal jejunal LN, followed by ileal LN, in comparison to the rest of the tissue samples evaluated. In general, tissue culture had the highest proportion of positive samples, with 62.5% (90/144) of positive samples, followed by F57/IS900 qPCR with 43.1% (56/130), and histopathology with 29.0% (38/131). We concluded that distal jejunum and its associated lymph nodes were the most reliable tissue samples for detecting Map, regardless of tissue autolysis or the absence of visible gross lesions. Finally, using IS1311 PCR-restriction enzyme analysis and single-nucleotide polymorphisms, we identified a type II (cattle) strain, secondary clade, in tissue samples. These findings have practical relevance for field necropsies as they provide evidence to direct selection of preferred sampling sites to detect Map in wood bison and to choose appropriate diagnostic techniques.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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