DIAGNOSTIC STRATEGIES AND STRAIN TYPING FOR JOHNE'S DISEASE IN WOOD BISON (BISON BISON ATHABASCAE)
Notice bibliographique
Résumé
Cattle diseases are considered a major threat to wood bison (Bison bison athabascae) conservation. Johne's disease (JD) is a chronic infectious enteritis caused by Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (Map), that affects domestic and wild ruminants globally and could negatively impact wood bison health. Clinical manifestation of JD in free-ranging or captive wood bison has not been documented. We studied animals in a captive wood bison herd in Alberta, Canada 1) to detect Map in bison clinically suspected of Johne's disease, by histopathology, quantitative PCR (qPCR), and isolation by culture; 2) to identify optimal tissue samples for Map detection; and 3) to identify the strain(s) of Map isolated. Six wood bison were evaluated with clinical signs suggestive of JD. We performed necropsies within 24-48 h after euthanasia and collected 24 tissue samples from each bison. At necropsy, no evidence of thickening or corrugation of the intestinal mucosa was observed in any bison. On histopathologic examination, granulomatous lesions with acid-fast bacilli were more frequent in the paracortex of the midjejunal lymph node (LN) and distal jejunal LN, followed by ileal LN, in comparison to the rest of the tissue samples evaluated. In general, tissue culture had the highest proportion of positive samples, with 62.5% (90/144) of positive samples, followed by F57/IS900 qPCR with 43.1% (56/130), and histopathology with 29.0% (38/131). We concluded that distal jejunum and its associated lymph nodes were the most reliable tissue samples for detecting Map, regardless of tissue autolysis or the absence of visible gross lesions. Finally, using IS1311 PCR-restriction enzyme analysis and single-nucleotide polymorphisms, we identified a type II (cattle) strain, secondary clade, in tissue samples. These findings have practical relevance for field necropsies as they provide evidence to direct selection of preferred sampling sites to detect Map in wood bison and to choose appropriate diagnostic techniques.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».