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Enregistrement W4408283599 · doi:10.1186/s12920-025-02105-8

A genome-wide association study of methamphetamine use among people with HIV

2025· article· en· W4408283599 sur OpenAlexaff
Tianye Jia, Stephanie A. Ruderman, Cameron B. Haas, Robin M. Nance, L. Sarah Mixson, K. H. Mayer, Michael S. Saag, G. Chander, R. D. Moore, Jeff Jacobson, S. Napravnik, Katerina Christopolous, Wen‐Jeng Lee, Bridget M. Whitney, Inga Peter, Heidi M. Crane, Joseph A. Delaney, Sara Lindström

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genomics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Human Genome Research InstituteNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismNational Institutes of Health
Mots-clésMethamphetamineSingle-nucleotide polymorphismGenome-wide association studyGenetic associationAmphetamineMedicinePsychiatryGeneticsPsychologyBiologyGenotypeInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Amphetamine-like stimulants are the most used psychostimulants in the world; methamphetamine use is the most prevalent in people with HIV. Prolonged methamphetamine use can cause lasting damage to the heart, gut, and brain, as well as auditory hallucinations and paranoid thinking. However, relatively little is known about methamphetamine use and its genetic contributors. METHODS: Using genetic information from the Centers for AIDS Research Network of Integrated Clinical Systems (CNICS) cohort, we conducted a multi-ancestry genome-wide association study (GWAS) of methamphetamine use among people with HIV (n = 1,196 reported ever use, n = 4,750 reported never use). RESULTS: ) in our study. Further, we did not replicate previously suggested genetic variants from other studies (all p > 0.05 in our analysis). DISCUSSION: Our study suggests that there is no single strong genetic contributor to lifetime use of methamphetamine in people with HIV enrolled in CNICS. Larger studies with more refined outcome assessment are warranted to further understand the contribution of genetics to methamphetamine use and use disorder. Investigation into social and environmental contributors to methamphetamine use are similarly necessary.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,468

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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