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Enregistrement W4408293897 · doi:10.5812/jjm-158623

Risk Factor Analysis and Prevalence of Infectious Agents in Inflammatory Bowel Disease Flares: A Retrospective Study

2025· article· en· W4408293897 sur OpenAlexaffabout
Ahmed Albadrani, Mishal A. Alshowair, Abdulrhman Khaled Al Abdulqader, Vivian Huang

Notice bibliographique

RevueJundishapur Journal of Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInflammatory bowel diseaseRetrospective cohort studyInfectious disease (medical specialty)DiseaseRisk factorKowsarInternal medicineTraditional medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Inflammatory bowel disease (IBD), which includes Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), is a chronic relapsing-remitting disorder with a rising global incidence. Infectious agents, particularly Clostridium difficile, are frequently considered during IBD flares. However, the role of other infectious agents during these exacerbations remains unclear. Objectives: The objective of the current study was to assess the prevalence of infectious agents, including C. difficile, in stool samples of patients with IBD flares and to assess potential risk factors. Methods: A retrospective review was conducted on medical records of IBD patients admitted for flare-ups at Mount Sinai Hospital, Toronto, from October 2018 to August 2019. Stool testing, including cultures, ova, parasites, and C. difficile, was analyzed. Demographic and clinical data were collected, and chi-square tests were used for statistical analysis. Results: A total of 96 patients (51 CD, 43 UC, 2 IBD-U) were included. Nine patients (9%) tested positive for C. difficile. No other bacterial or parasitic infections were detected. Testing for Cytomegalovirus was performed in 33 patients, with no positive cases. Risk factors, including IBD phenotype, biologic or steroid therapy, and prior antibiotic use, showed no significant association with C. difficile infection. Conclusions: Clostridium difficile was the predominant infectious agent in IBD flares, while other bacterial and parasitic infections were rare. Routine stool testing, particularly for non-C. difficile pathogens, has a low diagnostic yield in this population. Further studies with larger, generalized cohorts are needed to explore these associations and identify risk factors for infectious colitis in IBD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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