The infant microbiota hopscotches between community states toward maturation—longitudinal stool parameters and microbiota development in a cohort of European toddlers
Notice bibliographique
Résumé
The development of the gut microbiome is critical during early life and is associated with infant health. To test whether this development is deterministic and how it is influenced by factors such as diet and mode of birth, we studied microbiota profiles and fecal parameters of 540 European infants, fed a synbiotic or control infant formula during their first year of life, up to 36 months of age. The diversity of the microbiota gradually increased until 36 months, at which point it resembled adult community states, indicating that microbiota maturation had occurred. However, distinct gut microbiota community states were observed that differed at each stage of maturation. The distribution of infants within the communities even at 36 months was significantly influenced by early life events, with a higher prevalence of infants born by cesarean section having the immature M36-C1 community state at 36 months. The microbial community state at one time point was not predictive of the next; instead, we observed hopscotching of the infant microbiota between different community states. This work provides new longitudinal data on the infant gut microbiome in relation to diet, suggesting that ecosystem development is not deterministic, but that early life events influence the community state of an individual's gut microbiota beyond infancy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».