Patulin Detoxification by Evolutionarily Divergent Reductases of <i>Gluconobacter oxydans</i> ATCC 621
Notice bibliographique
Résumé
ATCC 621 can detoxify patulin to ascladiol using either the short-chain dehydrogenases/reductases (SDRs)─GOX0525, GOX1899, and GOX0716─or the aldo-keto reductase (AKR) GOX1462. While GOX0525 and GOX1899 have been previously characterized, this study focuses on GOX0716 and GOX1462, evaluating their optimal pH, thermostability, thermoactivity, and substrate specificity, thereby completing the characterization of all four reductases. GOX0716 and GOX1462 exhibit pH optima of 6 and 7, respectively, and are functional across a broad temperature range of 25-55 °C. GOX0716 was determined to be more thermostable than GOX1462, with a half-life of 4.95 h at 55 °C. Phylogenetic analysis revealed that these SDRs belong to distinct evolutionary families with broad substrate specificity. GOX0716 is a member of the SDR79 family, which shares a common ancestry with the SDR111 family of fungal anthrol reductases. Conversely, GOX1462 is a member of the AKR18 family, which is involved in detoxification of the mycotoxin, deoxynivalenol (DON). Molecular docking analysis of Alphafold models highlights distinct variations in the active site architectures of these SDRs and AKRs, offering insights into their differing catalytic efficiencies toward patulin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».