Tree tissues and species traits modulate the microbial methane-cycling communities of the tree phyllosphere
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Methanogenic and methanotrophic communities (i.e., the microbial communities involved in methane production and consumption) of the tree phyllosphere remain uncharacterized for most tree species despite increasing evidence of their role in regulating tree methane fluxes. Using 16S rRNA gene sequencing, we studied the methanogenic and methanotrophic communities of leaves, wood and bark of five tree species (Acer saccharinum, Fraxinus nigra, Ulmus americana, Salix nigra, and Populus tremuloides) growing in the floodplain of Lake St-Pierre (Québec). Results Methanogenic and methanotrophic communities differed mostly between tree tissues (leaf, wood and bark) but also between tree species according to different traits (e.g., leaf, heartwood and bark pH, leaf and heartwood humidity). Methanogens were prevalent in the wood of trees, while facultative methanotrophs were found in higher proportions than methanogens in leaves and bark, suggesting different potential role of these microbial communities in methane regulation. Tree species differing in key traits could also be associated with differential microbial production/consumption of methane. Tissue pH was a particularly important trait in modulating methanogen-methanotroph community composition and the relative abundance of methanogens and methanotrophs in the different phyllosphere compartments. Conclusion Our study shows that methanogens and methanotrophs are prevalent in the phyllosphere of several tree species, suggesting a potential widespread role in the regulation of tree methane fluxes. Tree species traits are important in determining the composition and abundance of phyllosphere methane-cycling microbial communities. Better understanding these microbial communities and their drivers can help assess their potential contribution to methane mitigation strategies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».