MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4408320490 · doi:10.1002/mgg3.70084

Reporting a Homozygous Case of Neurodevelopmental Disorder Associated With a Novel <scp><i>PRPF8</i></scp> Variant

2025· article· en· W4408320490 sur OpenAlexaff
Mohammad Reza Mirinezhad, Farzaneh Mirzaei, Arash Salmaninejad, Reza Jafarzadeh Esfehani, Mohammad Reza Seyedtaghia, Mehran Beiraghi Toosi, Somayyeh Hashemian, M. E. Suzanne Lewis

Notice bibliographique

RevueMolecular Genetics & Genomic Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExome sequencingGeneticsSanger sequencingNeurodevelopmental disorderMutationBiologyCopy-number variationComputational biologyPhenotypeGeneGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: While recently identified heterozygous PRPF8 variants have been linked to various human diseases, their role in neurodevelopmental disorders (NDDs) remains ambiguous. This study investigates the potential association between homozygous PRPF8 variants and NDDs. Most PRPF8 variants are primarily associated with retinal diseases; however, we analyze a family with multiple members diagnosed with NDDs. METHODS: Using exome sequencing (ES), the cause of behavioral problems and intellectual disabilities (IDs) of two sisters from a consanguineous parents was solved, and the results confirmed by direct sanger sequencing method likewise protein modeling to assess the structural impact of the identified variant on the PRPF8 protein has been done. RESULTS: ES identified a novel homozygous variant, PRPF8 c.257G>T, p.R86M. To the best of our knowledge at the time of writing this manuscript, the mentioned variant has not been reported in relation to NDDs. Protein modeling provided another line of evidence proving the pathogenicity of the novel variant. CONCLUSION: Our findings indicate that the p.R86M variant may disrupt normal protein function by changing its structure and probably its interaction, potentially leading to the observed neurodevelopmental phenotypes. This study highlights the first link between the PRPF8 variant and NDDs, suggesting a distinct role for specific PRPF8 variants in the etiology of NDDs. These results warrant further investigation into the mechanisms by which PRPF8 variants contribute to NDDs, emphasizing the need for comprehensive genetic screening in families with unexplained neurodevelopmental conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular Genetics & Genomic MedicineMême sujetGenomics and Rare DiseasesTravaux en français237 207