Discordant population structure inferred from male- and female-type mtDNAs from Macoma balthica, a bivalve species characterized by doubly uniparental inheritance of mitochondria
Notice bibliographique
Résumé
Doubly Uniparental Inheritance (DUI) of mitochondria is a remarkable exception to the Strictly Maternal Inheritance (SMI) in metazoans. In species characterized by DUI — almost exclusively gonochoric bivalve mollusks — females (F) transmit mitochondria to offspring of both sexes, while males (M) pass on their mitochondria exclusively to their sons. Under DUI, males are heteroplasmic, somatic tissues containing F-transmitted mtDNA and gametic cells containing M-transmitted mtDNAs. The aforementioned transmission routes make M- and F-transmitted mtDNA interesting as sex-specific markers which can differ in their effective population sizes, mutation rates, and selective constraints. For these reasons, looking at both markers can provide significant insights into the genetic structure of populations and investigate its determinants. In this study, we document differences in genetic diversity, divergence, inter-populational differentiation, and biogeographic structure between M- and F-type cox1 mt genes in the Baltic tellin ( Macoma balthica ) to test whether cox1m and cox1f genes bear the marks of similar phylogeographic histories. These markers were sequenced for 302 male individuals sampled from the North Sea to the Gironde Estuary (Southern France) encompassing the intra-subspecific M. b. rubra hybrid zone in the Gulf of Saint-Malo. Both genes supported a scenario of cladogenesis of M.b. rubra clades prior to the last glacial maximum. Nucleotide diversity and net divergence were over twice higher in cox1m compared to cox1f . Genetic differentiation between northern and southern populations was nearly 3 times higher at cox1m compared to cox1 f (global ΦST = 0.345 and 0.126 respectively) and the geographic localization of the strongest genetic break significantly differed between the markers (Finistère Peninsula at cox1f ; Cotentin Peninsula at cox1m , ~250 km apart). A higher mutation rate, relaxed negative selection, and differences in effective population sizes (depending on locations) at cox1m could explain differences in population genetic structure. As both F- and M-type mtDNAs interact with nuclear genes for oxidative phosphorylation and ATP production, geographical discordances in genetic clines in a context of secondary contact could be linked to mito-nuclear genetic incompatibilities.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».