Differential effect of ubiquitous and germline depletion of Integrator complex function on <i>C. elegans</i> physiology
Notice bibliographique
Résumé
The Integrator is a metazoan-conserved protein complex with endonuclease activity that functions to cleave various RNA substrates to shape transcriptome homeostasis by coordinating small nuclear RNA biogenesis to premature transcription termination. Depletion of Integrator results in developmental defects across different model systems and has emerged as a causative factor in human neurodevelopmental syndromes. Here, we used the model system Caenorhabditis elegans to enable study of the temporal effects of Integrator depletion on various physiological parameters with the auxin-inducible degron system that permitted depletion of INTS-4 (Integrator subunit) catalytic subunit of the protein complex. We found that Integrator activity is critical and required for C. elegans development within the L1 larval stage but becomes dispensable for development and lifespan after the animals have reached the L2/L3 stage. Depletion of INTS-4 only shortened lifespan if auxin was introduced at the L1 stage, suggesting that the previously described lifespan reduction by Integrator inhibition is linked to developmental growth defects. We also found that while germline-specific degradation of Integrator results in the accumulation of misprocessed snRNA transcript, it did not impair the development or lifespan but surprisingly increased progeny production. Together, our study illustrates a temporal, and a potentially tissue-specific requirement of the Integrator complex function in shaping whole organism development, aging, and reproduction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».