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Enregistrement W4408391685 · doi:10.1093/sleep/zsaf061

A foundational transformer leveraging full night, multichannel sleep study data accurately classifies sleep stages

2025· article· en· W4408391685 sur OpenAlexfundno aff
Benjamin Fox, Joy Jiang, Sajila Wickramaratne, Patricia Kovatch, Mayte Suárez‐Fariñas, Neomi Shah, Ankit Parekh, Girish N. Nadkarni

Notice bibliographique

RevueSLEEP · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueEEG and Brain-Computer Interfaces
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Research ResourcesNational Institutes of HealthCase Western Reserve UniversityNational Institute on AgingUniversity of WashingtonYork UniversityJohns Hopkins UniversityNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of California, DavisUniversity of Minnesota
Mots-clésPolysomnogramMesaTransformerComputer scienceArtificial intelligenceSleep apneaPolysomnographyMachine learningMedicineApneaEngineeringCardiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

STUDY OBJECTIVES: To evaluate whether a foundational transformer using 8-hour, multichannel polysomnogram (PSG) data can effectively encode signals and classify sleep stages with state-of-the-art performance. METHODS: The Sleep Heart Health Study, Wisconsin Sleep Cohort, and Osteoporotic Fractures in Men (MrOS) Study visit 1 were used for training, and the Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis (MESA), Apnea Positive Pressure Long-term Efficacy Study (APPLES), and MrOS visit 2 served as independent test sets. We developed PFTSleep, a self-supervised foundational transformer that encodes full-night sleep studies with brain, movement, cardiac, oxygen, and respiratory channels. These representations were used to train another model to classify sleep stages. We compared our results to existing methods, examined differences in performance by varying channel input data and training dataset size, and investigated an AI explainability tool to analyze decision processes. RESULTS: PFTSleep was trained with 13 888 sleep studies and tested on 4169 independent studies. Cohen's Kappa scores were 0.81 for our held-out set, 0.59 for APPLES, 0.60 for MESA, and 0.75 for MrOS Visit 2. Performance increases to 0.76 on a held-out MESA set when MESA is included in the training of the classifier head but not the transformer. Compared to other state-of-the-art AI models, our model shows high performance across diverse datasets while only using task-agnostic PSG representations from a foundational transformer as input for sleep stage classification. CONCLUSIONS: Full night, multichannel PSG representations from a foundational transformer enable accurate sleep stage classification comparable to state-of-the-art AI methods across diverse datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,681
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,122
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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