A chromosome 2 locus influences the onset of radiation-induced lung disease in mice
Notice bibliographique
Résumé
Purpose The onset of distress from radiation-induced lung disease differs among patients and among inbred strains of mice exposed to thoracic cavity radiotherapy. For the latter specifically, C3H/HeJ mice present distress due to pneumonitis at approximately 10–14 weeks following thoracic irradiation, while C57BL/6J mice show distress due to pneumonitis with pulmonary fibrosis at 22–30 weeks. Mapping studies completed in offspring derived from these inbred strains revealed a chromosome 2 locus to be linked to onset of distress in irradiated mice. Herein, we bred and phenotyped a panel of chromosome 2 subcongenic mice with 64 Mb of C3H/HeJ alleles on a C57BL/6J background, to investigate the contribution of the chromosome 2 locus to radiation-induced lung disease.Materials and methods Mice received 18 Gy to the thoracic cavity and were monitored for the onset of distress. Lung disease was assessed histologically and with bronchoalveolar lavage.Results Following whole thorax irradiation, subcongenic mice with C3H/HeJ alleles from 95 to 123 Mb showed significantly earlier onset of respiratory distress (16–22 weeks; p < .02) from pneumonitis and fibrosis compared to C57BL/6J mice. These subcongenic mice did not differ from C57BL/6J mice in pneumonitis (p = .23), mast cell counts (p = .96), or lavage neutrophils (p = .69), evident at distress. In silico analyses reveal 246 protein coding genes mapped within the reduced region, 52 of which differ in pulmonary expression of C3H/HeJ, compared to C57BL/6J, mice after whole thorax irradiation.Conclusions We have identified a 28 Mb region of chromosome 2 to influence the onset of radiation-induced lung disease in mice.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».