The strand-selective regulation of miR-155 in response to lipopolysaccharide by CELF2, FUBP1 and KSRP proteins
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The microRNA-155 exists in two forms, miR-155-5p and miR-155-3p, produced from either strand of the double-stranded precursor of miR-155. The more abundant and better-studied miR-155-5p has been implicated in many biological processes with dysregulated expression occurring in human diseases. miR-155-5p plays an essential role in supporting inflammatory responses in macrophages. Activating macrophages with lipopolysaccharide elevates miR-155-5p, while the anti-inflammatory cytokine interleukin-10 reduces miR-155-5p levels. Recently, miR-155-3p has also been suggested to participate in macrophage function, although its specific role is unclear. We found that LPS stimulation of macrophages results first in the elevation of miR-155-3p levels, followed by an increase in miR-155-5p levels. In this paper, we explore the mechanisms involved in the maturation of the pre-miR-155 to either miR-155-5p or miR-155-3p. We describe the contribution of three RNA-binding proteins, CELF2, FUBP1 and KSRP, to pre-miR-155 processing. Our data suggests CELF2 regulates miR-155-5p/miR-155-3p strand selection. FUBP1 may support the expression of miR-155-3p for specific subcellular functions, while KSRP appears to inhibit both miR-155-5p and miR-155-3p maturation without altering the relative expression of each strand.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».