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Enregistrement W4408412670 · doi:10.1101/2025.03.07.642096

A field experiment assessing the roles of drought, herbivory, and local climate on cyanogenesis cline formation and local adaptation in <i>Trifolium repens</i>

2025· preprint· en· W4408412670 sur OpenAlexaff
Lucas J. Albano, Courtney M. Patterson, Evan J Kidder, Nicholas J. Kooyers, Marc T. J. Johnson

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueCassava research and cyanide
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCline (biology)HerbivoreTrifolium repensAdaptation (eye)Local adaptationBiologyGeographyAgronomyEcologyDemographySociologyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Projecting how a population will adapt to environmental changes requires a mechanistic understanding of the specific biotic and abiotic factors that impose selection on that population. In white clover ( Trifolium repens ), clines in an antiherbivore defense mechanism, hydrogen cyanide (HCN), form via variation in selection imposed by the environment. However, the specific environmental factors that select for or against chemical defense phenotypes in white clover remain unresolved. We performed a field experiment in high and low latitude study sites, with a factorial manipulation of precipitation and herbivory at each site. These factors are hypothesized to be important in driving HCN cline formation, so we investigated their effects on fitness of a white clover F3 recombinant population, segregating for the alleles underlying the HCN chemical defense phenotype. Surprisingly, we found precipitation and herbivory either did not drive differential selection on HCN or its metabolic components, or did not impose selection in a manner consistent with the maintenance of observed HCN clines. Instead, we find that the production only one of the metabolic components of HCN, cyanogenic glycosides, resulted in a fitness advantage, even when lacking the ability to produce HCN. This was most prominent at the northern study site, which is again contrary to expectations. These results suggest additional physiological roles that cyanogenic glycosides may play in adaptation and the evolutionary ecology of white clover. This study highlights the importance of experimental manipulations of environmental factors to understand how selection acts on genes underlying important phenotypic traits, often in unexpected ways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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