Microorganisms in the air through the lenses of atmospheric chemistry and microphysics 
Notice bibliographique
Résumé
Microorganisms in the atmosphere comprise a tiny fraction (~10-8%) of the Earth’s microbiome. A significant portion of this ‘aeromicrobiome’ consists of bacteria that typically remain airborne for a few days before being returned to the ground through wet or dry deposition. Unlike bacteria in the other Earth surface spheres (e.g., litho-, hydro-, phyllo-, cryospheres), atmospheric bacteria are aerosolized, residing in individual particles and separated by considerable distances (a few centimeters) from each other. Within these small isolated microcosms, bacteria are exposed to particular chemical and physical conditions that potentially affect their stress levels, survival and general functioning. Using fundamental chemical and microphysical concepts of atmospheric aerosol particles and cloud droplets, we examine these specific environmental conditions. In particular, we challenge the concept of clouds as microbial oases by illustrating the water amounts and time scales inside clouds. In addition, we suggest that the small volumes of cloud droplets may cause greater nutrient limitations but simultaneously reduce oxidative stress compared to other aquatic environments. Various chemical and microphysical factors may act as microbial stressors (e.g., oxidative, osmotic, and UV-induced) in the atmosphere, which may either enhance or diminish the survival and diversity of atmospheric bacteria. Based on established atmospheric chemical and microphysical principles, we discuss that observed trends of bacterial community properties and pollutant concentrations may lead to incorrect interpretations due to confounding factors. In summary, our presentation aims to motivate future experimental and modeling studies to disentangle the complex interplay of chemical and microphysical factors with the atmospheric microbiome. Such studies are important to eventually allow for a comprehensive understanding of the atmosphere’s role in affecting airborne microorganisms, a small yet rapidly evolving component of the Earth’s microbiome. Ervens, B., Amato, P., Aregahegn, K., Joly, M., Khaled, A., Labed-Veydert, T., Mathonat, F., Nuñez López, L., Péguilhan, R., and Zhang, M.: Ideas and perspectives: Microorganisms in the air through the lenses of atmospheric chemistry and microphysics, Biogeosciences, 22, 243–256, https://doi.org/10.5194/bg-22-243-2025, 2025.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».