MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4408498771 · doi:10.1186/s13007-025-01355-y

A Bayesian framework to model variance of grain yield response to plant density

2025· article· en· W4408498771 sur OpenAlexaffabout
Nicolas Giordano, Deborah C. Hayes, Trevor J. Hefley, Josefina Lacasa, Brian L. Beres, Lucas A. Haag, Romulo P. Lollato

Notice bibliographique

RevuePlant Methods · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesKansas Wheat Commission
Mots-clésYield (engineering)Plant densityVariance (accounting)StatisticsGrain yieldProbability density functionMathematicsAgronomySeedingCrop yieldConstant (computer programming)BiologyComputer scienceSowingPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The expected grain yield response to plant density in winter wheat (Triticum aestivum L.) follows a diminishing returns function. To our knowledge, all previous studies dealing with plant density have assumed constant variance. The gap relies on quantifying the optimum plant density that optimizes grain yield at the lowest risk. Here, we propose a Bayesian hierarchical framework to model the variance of grain yield response to plant density. We demonstrate our framework by identifying the plant density in each seed size, seed treatment and environment combination that maximizes the expected yield and minimizes yield variance. RESULTS: To fit the model, we used data from field experiments conducted in the Canadian Prairies to identify informative priors and Kansas experiments to demonstrate and validate our framework. Kansas experiments were conducted in 25 environments and consisted of a complete factorial combination of three seed cleaning methods leading to three different seed sizes (light, moderate, heavy), two or three seeding rates, and two seed chemical treatments (insecticide + fungicide vs. none). We described both expected yield and variance of yield in response to plant density. The proposed model allowed us to quantify the minimum risk plant density (minRPD), which represents the minimum plant density at which grain yield variance becomes constant. Plant density at the minRPD was always greater than the agronomic optimum plant density (AOPD, i.e.: the plant density that maximizes expected yield); thus, minRPD could be used to estimate the minimum plant density that maximizes expected yield and minimizes yield variance. When compared at the AOPD, four seed cleaning × chemical treatments combinations resulted in similar yield advantages over the control under high and low yielding environments. However, in low-yielding environments, only two cleaning × chemical treatments combinations resulted in smaller variance when compared at the minRPD against the control. All seed cleaning × chemical treatments combinations resulted in similar AOPD. However, two cleaning × chemical treatments combinations had greater minRPD in low-yield environments compared to the control. CONCLUSION: Modeling grain yield response to plant density with the proposed framework is suitable for heteroscedastic data scenarios. Future research may focus on exploring how genotypes, environments and their interaction modulate the difference between AOPD and minRPD and, extend the framework to a variety of processes involving crop management decisions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,063

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePlant MethodsMême sujetWheat and Barley Genetics and PathologyTravaux en français237 207