MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4408520473 · doi:10.1093/femsec/fiaf024

Evaluation of <i>Thiobacillus denitrificans</i>’ sustainability in nitrate-reducing Fe(II) oxidation and the potential significance of Fe(II) as a growth-supporting reductant

2025· article· en· W4408520473 sur OpenAlexaff
Stefanie Becker, Thu Thi Dang, Ran Wei, Andreas Kappler

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Fuel Cells and Bioremediation
Établissements canadiensInnovation Cluster (Canada)
Organismes subventionnairesBundesministerium für Bildung und ForschungDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésNitrateDenitrificationThiosulfateNitriteElectron acceptorInorganic chemistryRedoxThiobacillusElectron donorChemistryNuclear chemistryEnvironmental chemistrySulfurBiochemistryCatalysisNitrogenOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The betaproteobacterium Thiobacillus denitrificans (ATCC 25259) oxidizes Fe(II) while reducing nitrate, yet its capacity for autotrophic growth as a nitrate-reducing Fe(II)-oxidizer remains uncertain. This study explored this capacity through cultivation experiments across multiple transfers, using growth medium with Fe(II) and nitrate as sole electron donor and acceptor, respectively. This setup necessitated nitrate reduction coupled to Fe(II) oxidation as the primary energy-yielding mechanism and Fe(II) as the exclusive electron donor for CO2 fixation and biomass production. Thiosulfate/nitrate pregrown T. denitrificans oxidized 42% of 10 mM Fe(II), reduced 54% of 3.5 mM nitrate, and accumulated 1.6 mM nitrite, but showed no cell growth. Subsequent transfers from this Fe(II)/nitrate culture to fresh medium with Fe(II) and nitrate showed no nitrate-reducing Fe(II) oxidation or population growth. While bacterial activity [Fe(II) oxidation, nitrate reduction] occurred in the first transfer from thiosulfate/nitrate to Fe(II)/nitrate, nitrite was produced, further reacting with Fe(II) abiotically (chemodenitrification). A kinetic model assessed enzymatic versus abiotic Fe(II) oxidation, revealing enzymatic oxidation accounted for twice as much (ca. 70%) as abiotic denitrification (ca. 30%) within 22 days. These findings suggest T. denitrificans performs the first step of denitrification with Fe(II) as an electron donor but does not achieve autotrophic growth under these conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,537

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFEMS Microbiology EcologyMême sujetMicrobial Fuel Cells and BioremediationTravaux en français237 207