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Enregistrement W4408521439 · doi:10.1109/bhi62660.2024.10913687

Artificial Intelligence-Enabled Retinal Vasculometry at Scale Utilizing the UK Biobank, CLSA, and NEL DESP Datasets

2024· article· en· W4408521439 sur OpenAlexafffundabout
Roshan A. Welikala, Jiri Fajtl, Gordon Johnson, Farzana Rahman, Razvan Podoleanu, Paolo Remagnino, Ellen E. Freeman, Ryan Chambers, Louis Bolter, John Anderson, Abraham Olvera‐Barrios, Alasdair Warwick, Paul J. Foster, Royce Shakespeare, Rahul Ganguly, Catherine Egan, Adnan Tufail, Christopher G. Owen, Alicja R. Rudnicka, Sarah Barman

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Imaging and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiobankScale (ratio)Computer scienceRetinalMedicineBiologyBioinformaticsGeographyOphthalmologyCartography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Retinal imaging offers a non-invasive means to assess the circulatory system, with morphological features of retinal vessels serving as biomarkers for systemic disease. QUARTZ (QUantitative Analysis of Retinal vessel Topology and siZe) is a fully automated artificial intelligence-enabled retinal vasculometry system designed to process large-scale retinal image datasets to obtain quantitative measures of vessel morphology for use in epidemiological studies. Previously reliant on traditional image processing and machine learning, QUARTZ has now transitioned to a deep learning pipeline. Currently individually trained versions are tailored to specific datasets. Evaluation using the UK Biobank retinal dataset shows improvements in performance metrics: the F1 score for vessel segmentation increased from 0.7753 to 0.8472, accuracy for the A/V segment-level decision increased from 0.8524 to 0.9022, the detection rate for optic disc localization increased from 0.9760 to 0.9933, and the F1 score for image quality classification increased from 0.8872 to 0.9750. QUARTZ distinguishes itself from other deep learning based retinal vasculometry systems through its efficient use of data, extracting valuable information despite issues such as low levels of illumination. The high performance of QUARTZ is consistent across two other extensive retinal datasets, namely the Canadian Longitudinal Study on Aging (CLSA) and the North East London Diabetic Eye Screening Programme (NEL DESP). Evaluation on subsets was preceded by the automatic processing of entire retinal datasets by QUARTZ, processing over 1.4 million images. These retinal vasculometry outputs will serve as a valuable resource for epidemiological studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,598
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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