MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4408544223 · doi:10.7554/elife.105339.1

Ezh2 Delays Activation of Differentiation Genes During Normal Cerebellar Granule Neuron Development and in Medulloblastoma

2025· preprint· en· W4408544223 sur OpenAlexaff
James Purzner, Alexander S. Brown, Teresa Purzner, Lauren Ellis, Sara Broski, Ulrike Litzenburger, Katharine Andrews, Xin Wang, Michael D. Taylor, Yoon-Jae Cho, Margaret T. Fuller, Matthew P. Scott

Notice bibliographique

RevueeLife · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaEZH2CerebellumNeuronNeuroscienceGeneBiologyGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Medulloblastoma (MB) is the most common malignant brain tumour in children. The Sonic Hedgehog (SHH)-medulloblastoma subtype arises from the cerebellar granule neuron lineage. Terminally differentiated neurons are incapable of undergoing further cell division, so an effective treatment for this tumour could be to force neuronal differentiation. Differentiation therapy provides a potential alternative for patients with medulloblastoma who harbor mutations that impair cell death pathways (TP53), which is associated a with high mortality. To this end, our goal was to explore epigenetic regulation of cerebellar granule neuron differentiation in medulloblastoma cells. Key regulators were discovered using chromatin immunoprecipitation with high-throughput sequencing. DNA-bound protein and chromatin protein modifications were investigated across all genes. We discovered that Ezh2-mediated tri-methylation of the H3 histone (H3K27me3), occurred on more than half of the 787 genes whose transcription normally increases as granule neurons terminally differentiate. Conditional knockout of Ezh2 led to early initiation of differentiation in granule neuron precursors (GNPs), but only after cell cycle exit had occurred. Similarly, in MB cells, neuronal differentiation could be induced by preventing H3K27me3 modifications using an Ezh2 inhibitor (UNC1999), but only when UNC1999 was combined with forced cell cycle exit driven by a CDK4/6 inhibitor (Palbociclib). Ezh2 emerges as a powerful restraint upon post-mitotic differentiation during normal GNP development and combination of Ezh2 inhibition with cell cycle exit leads to MB cell differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueeLifeMême sujetGenomics and Chromatin DynamicsTravaux en français237 207