Neonatal gut microbiota succession in mice mapped over time, site, injury and single immunoglobulin interleukin-1 related receptor genotype
Notice bibliographique
Résumé
Summary Microbial succession during postnatal gut development in mice is likely impacted by site of sampling, time, intestinal injury, and host genetics. We investigated this in wild-type and Sigirr transgenic mice that encode the p.Y168X mutation identified in a neonate with necrotizing enterocolitis (NEC). Temporal profiling of the ileal and colonic microbiome after birth to weaning revealed a clear pattern of progression from a less diverse, Proteobacteria/Escherichia_Shigella dominant community to a more diverse, Firmicutes/Bacteroidetes dominant community. Formula milk feeding, a risk factor for necrotizing enterocolitis, decreased Firmicutes and increased Proteobacteria leading to enrichment of bacterial genes denoting exaggerated glycolysis and increased production of acetate and lactate. Sigirr transgenic mice exhibited modest baseline differences in microbiota composition but exaggerated formula feeding-induced dysbiosis, mucosal inflammation, and villus injury. Postnatal intestinal microbiota succession in mice resembles human neonates and is shaped by developmental maturity, ileal vs. colonic sampling, formula feeding, and Sigirr genotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».