Base excision repair DNA genetic variant OGG1 Ser326Cys among Saudi population: a comparative approach with worldwide ethnic group variations
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: DNA integrity is affected by both internal and external damage, but repair mechanisms usually restore it. Base excision repair (BER) is crucial for genome maintenance, with mutations in BER genes linked to higher cancer risk. The 8-oxoguanine DNA glycosylase-1 (OGG1) gene is vital in the BER pathway. Polymorphisms in DNA repair genes can reduce repair efficiency and elevate cancer risk. This study examined the frequency of the OGG1 exon 7 C>G (Ser326Cys) variant in the Saudi population and compared it globally.METHODS: The PubMed (Medline) internet database was examined for epidemiological studies on various ethnic groups. Allele and genotype frequencies of OGG1exon 7 C>G was determined. All statistical analysis was done using SPSS 21 software.RESULTS: The minor allele (G) frequency in Saudi population was 24%. It was higher in comparison with Iraq, Iran, Italy, Germany, USA, Pakistan and Belarus. Subsequently, Minor allele frequency G was found higher in Thailand (50%), Türkiye (33%), South Korea (52%), Japan (46%), India (27%), Algeria (29%), Canada (28%), China (36%), and Norway (27%) compare to Saudi population. Significant frequency distributions of variant genotype were observed for Thailand (P=0.041), and South Korea (P=0.012) compared with Saudi Arabian population.CONCLUSIONS: The findings of this study indicate that, in comparison to other ethnic populations, the frequency of the OGG1exon 7 C>G DNA repair gene shows a different pattern in the Saudi population, which may be related to ethnic variance. This might help with cancer propensity in various ethnic groups and high-risk screening of those exposed to environmental toxins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».