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Enregistrement W4408582543 · doi:10.1101/2025.03.17.643763

Mapping energy metabolism systems in the human brain

2025· preprint· en· W4408582543 sur OpenAlexaff
Moohebat Pourmajidian, Justine Y. Hansen, Golia Shafiei, Bratislav Mišić, Alain Dagher

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiet and metabolism studies
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEnergy metabolismHuman brainEnergy (signal processing)NeuroscienceComputer scienceComputational biologyBiologyPhysicsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Energy metabolism involves a network of biochemical reactions that generate ATP, utilizing substrates such as glucose and oxygen supplied via cerebral blood flow. Energy substrates are metabolized in multiple interrelated pathways that are cell- and organelle-specific. These pathways not only generate energy but are also fundamental to the production of essential biomolecules required for neuronal function and survival. How these complex biochemical processes are distributed over the cortex is integral to understanding the structure and function of the brain. Here, using curated gene sets and whole-brain transcriptomics, we generate maps of five fundamental energy metabolic pathways: glycolysis, pentose phosphate pathway, tricarboxylic acid cycle, oxidative phosphorylation and lactate metabolism. We find consistent divergence between primarily energy-producing pathways and anabolic pathways, particularly in unimodal sensory cortices. We then explore the spatial alignment of these maps with multi-scale structural and functional attributes, including metabolic uptake, neurophysiological oscillations, cell type composition, laminar organization and macro-scale connectivity. Finally, we show that metabolic pathways exhibit unique developmental trajectories from the fetal stage to adulthood. The primary energy-producing pathways peak in late childhood, while the anabolic pentose phosphate pathway shows pronounced expression in the fetal stage and declines throughout life. Together, these results highlight the rich biochemical complexity of energy metabolism organization in the brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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