A locus control region generates distinct active placental lactogen and inactive growth hormone gene domains in term placenta that are disrupted with obesity
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Placental villi include an outer syncytiotrophoblast (STB) layer and an inner layer of cytotrophoblasts (CTBs) that fuse to generate the STB layer in pregnancy. While activation of the locus containing the human (h) placental lactogen (hPL) genes (hPL-A/CSH1 and hPL-B/CSH2) begins in the CTBs, their expression in the STB requires epigenetic modifications and interactions between locus control region (LCR) and gene regulatory sequences. No factor that limits or facilitates hPL LCR/gene interactions for locus activation is reported. The paternally-expressed gene 3 (PEG3/PW1) transcription factor was pursued as a candidate. PEG3 is expressed by villous CTBs but not the STB and putative binding sites were identified in hPL-related sequences. METHODS: PEG3 expression was assessed in multiple cell types including in CTB-like JEG-3 cells. PEG3 binding was also assessed in JEG-3 cells and term placenta samples from women with or without maternal obesity, where chromosomal architecture of the hPL gene locus was also examined. RESULTS: In JEG-3 cells, PEG3 was found to bind to hypersensitive site (HS III-V) sequences within the LCR. Knockdown of PEG3 in these cells resulted in increased hPL gene expression. In term placenta, PEG3 binding at placenta-specific HS IV was increased with maternal obesity, where a decrease in hPL RNA levels is seen, while PEG3 binding was reduced in women with obesity who develop insulin-treated gestational diabetes mellitus (O/GDM + Ins), where increased hPL gene expression is observed. Chromatin conformation capture revealed distinct hPL gene domain interactions that are modified with maternal obesity but largely reversed in O/GDM + Ins, correlating with PEG3 binding. DISCUSSION: Decreased PEG3 binding may be required for hPL domain generation and expression during CTB to STB transition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».