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Enregistrement W4408605106 · doi:10.1101/2025.03.17.643703

An early functional adaptive NK cell signature drives optimal CD8 <sup>+</sup> T-cell activation and predicts sustained HIV-1 viral control

2025· preprint· en· W4408605106 sur OpenAlexaff
Aljawharah Alrubayyi, Amin S. Hassan, Jonathan Hare, Anthony Y.Y. Hsieh, Jill Gilmour, Matt A. Price, William Kilembe, Etienne Karita, Eugene Ruzagira, Joakim Esbjörnsson, Eduard J. Sanders, Dimitra Peppa, Sarah Rowland‐Jones

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunologyImmune systemCytotoxic T cellBiologyCD8Viral loadAcquired immune systemAntibody-dependent cell-mediated cytotoxicityT cellAntibodyVirologyVirusMonoclonal antibodyIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A better understanding of the immune responses associated with future viral control in humans during acute HIV-1 infection (AHI) is critical to inform vaccines and immune-based therapeutics. Natural killer (NK) cells and CD8 + T-cells are pivotal in antiviral defence, yet the dynamics and complementary roles of these effector subsets during AHI with different HIV-1 subtypes remain poorly understood. Access to a unique patient cohort recruited during and post-peak HIV-1 viral load with different HIV-1 subtypes and followed up longitudinally in the absence of antiretroviral therapy up to six years post estimated date of infection (EDI) provided a rare opportunity to fill this knowledge gap. Our data show an early expansion of FcεRγ − CD57 + NK cells with classical adaptive traits concomitant with an enhanced capacity for antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) and reactivity against HIV-1 antigens. This distinctive NK cell profile was more abundant in donors with subtype A infection compared to non-subtype A, partially driven by elevated pro-inflammatory cytokine levels and changes in the epigenetic landscape. The accumulation of adaptive NK cells during the first month of infection contributed to the optimal activation of CD8 + T-cells, promoting virus-specific responses. Notably, individuals with higher levels of FcεRγ − CD57 + adaptive NK cells during the first month of infection were more likely to exhibit long-term viral control in the absence of ART. These findings underscore the critical role of early, high-magnitude adaptive NK cell responses in CD8 + T-cell activation and subsequent immune control. This work provides novel insights into the correlates of protective immunity against HIV-1 infection, with implications for preventative or therapeutic vaccine strategies aimed at promoting adaptive NK cell responses. One Sentence Summary Early expansion of adaptive NK cells during acute HIV-1 infection promotes long-term viral control.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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