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Enregistrement W4408605202 · doi:10.1101/2025.03.18.642594

The Global Wheat Full Semantic Organ Segmentation (GWFSS) Dataset

2025· preprint· en· W4408605202 sur OpenAlexaff
Zijian Wang, Radek Zenkl, Latifa Greche, Benoît de Solan, Lucas Bernigaud Samatan, Safaa Ouahid, Andrea Visioni, Carlos A. Robles‐Zazueta, Francisco Pinto, Ivan Perez-Olivera, Matthew Reynolds, Chen Zhu, Shouyang Liu, Marie-Pia D'argaignon, Raúl López‐Lozano, Marie Weiss, Afef Marzougui, Lukas Roth, Sébastien Dandrifosse, Alexis Carlier, Benjamin Dumont, Benoît Mercatoris, Javier A. Fernández, Scott Chapman, Keyhan Najafian, Ian Stavness, Haozhou Wang, Wei Guo, Nicolas Virlet, Malcolm J. Hawkesford, Zhi Chen, Étienne David, Joss Gillet, Kamran Irfan, Alexis Comar, Andreas Hund

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueArtificial Intelligence in Healthcare
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesHORIZON EUROPE Framework ProgrammeHorizon 2020 Framework ProgrammeGrain Research and Development Corporation
Mots-clésSegmentationComputer scienceArtificial intelligenceNatural language processing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Computer vision is increasingly used in farmers’ fields and agricultural experiments to quantify important traits. Imaging setups with a sub-millimetre ground sampling distance enable the detection and tracking of plant features, including size, shape, and colour. Although today’s AI-driven foundation models segment almost any object in an image, they still fail for complex plant canopies. To improve model performance, the global wheat dataset consortium assembled a diverse set of images from experiments around the globe. After the head detection dataset (GWHD), the new dataset targets a full semantic segmentation (GWFSS) of wheat organs (leaves, stems and spikes) covering all developmental stages. Images were collected by 11 institutions using a wide range of imaging setups. Two datasets are provided: i) a set of 1096 diverse images in which all organs were labelled at the pixel level, and (ii) a dataset of 52,078 images without annotations available for additional training. The labelled set was used to train segmentation models based on DeepLabV3Plus and Segformer. Our Segformer model performed slightly better than DeepLabV3Plus with a mIOU for leaves and spikes of ca. 90%. However, the precision for stems with 54% was rather lower. The major advantages over published models are: i) the exclusion of weeds from the wheat canopy, ii) the detection of all wheat features including necrotic and senescent tissues and its separation from crop residues. This facilitates further development in classifying healthy vs. unhealthy tissue to address the increasing need for accurate quantification of senescence and diseases in wheat canopies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,446
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0030,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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