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Enregistrement W4408641970 · doi:10.1101/2025.03.14.643205

Inflammatory bowel disease risk gene C1ORF106 regulates actin dynamics in intestinal epithelial cells

2025· preprint· en· W4408641970 sur OpenAlexaff
Isabelle Hébert-Milette, Chloé Lévesque, J. L. Paquette, Marie-Ève Rivard, Louis Villeneuve, Gabrielle Boucher, Philippe Goyette, Guy Charron, John D. Rioux

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBarrier Structure and Function Studies
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAdherens junctionCell biologyTight junctionActinBarrier functionCell polarityActin cytoskeletonBiologyIntestinal permeabilityCell migrationEpithelial polarityCell junctionOccludinCellCytoskeletonImmunologyCadherinGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background and aims: C1ORF106 has previously been associated with inflammatory bowel diseases (IBD) via large-scale genetic studies. Increased intestinal permeability is a hallmark of IBD and is observed in at-risk individuals prior to the appearance of clinical symptoms. C1ORF106 was previously shown to regulate intestinal barrier permeability through the regulation of adherens junction stability and through the formation of tight junctions, which impacted actin assembly. However, the downstream impact and molecular mechanisms involved in actin regulation by C1ORF106 haven't been explored. Our study aimed at identifying which pathways involved in intestinal epithelial barrier regulation and F-actin regulation are impacted by C1ORF106 and its IBD-associated variant. Methods: in human colonic epithelial cells and characterized the function of the 333F variant in intestinal epithelial spheroid cultures obtained from patient-derived human induced pluripotent stem cell (hiPSC). We measured barrier permeability and characterized spheroid formation, actin regulation and cell migration though immunofluorescence, western blots and permeability assays. Results: C1ORF106 KD leads to impaired cortical actin belt dynamics and regulation of stress fiber formation, resulting in increased cell constriction, impaired barrier permeability, cell polarity and cell migration. Moreover, we demonstrated that an inhibition of ROCK rescues the actin belt and cell polarity phenotypes in C1ORF106 KD cells, demonstrating that C1ORF106 regulates these phenotypes through a ROCK-dependent mechanism. We also observed an altered nmMYO2-P localization in C1ORF106 KD cells associated with the formation of Vacuolar Apical Compartments (VACs), which are important for 3D epithelial spheroid formation. We observed a similar impact on cell polarity in intestinal epithelial spheroids obtained from hiPSC carrying the 333F variant, providing additional support that this pathway is involved in disease development. Conclusion: We provide insights into the molecular mechanisms by which C1ORF106 controls actin dynamics to regulate intestinal epithelial integrity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,100
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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