Exploring associations between estrogen and gene candidates identified by coronary artery disease genome-wide association studies
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Coronary artery disease (CAD) is the leading cause of death around the world, with epidemiological sex and gender differences in prevalence, pathophysiology and outcomes. It has been hypothesized that sex steroids, like estrogen, may contribute to these sex differences. There is a relatively large genetic component to developing CAD, with heritability estimates ranging between 40%-60%. In the last two decades, genome-wide association studies (GWAS) have contributed substantially to advancing the understanding of genetic candidates contributing to CAD. The aim of this study was to determine if genes discovered in CAD GWASs are affected by estrogen via direct modulation or indirect down-stream targets. Methods: A scoping review was conducted using MEDLINE and EMBASE for studies of atherosclerotic coronary artery disease and a genome-wide association study (GWAS) design. Analysis was limited to candidate genes with corresponding single nucleotide polymorphisms (SNPs) surpassing genome-wide significance and had been mapped to genes by study authors. The number of studies that conducted sex-stratified analyses with significant genes were quantified. A literature search of the final gene lists was done to examine any evidence suggesting estrogen may modulate the genes and/or gene products. Results: There were 60 eligible CAD GWASs meeting inclusion criteria for data extraction. Of these 60, only 36 had genome-wide significant SNPs reported, and only 3 of these had significant SNPs from sex-stratified analyses mapped to genes. From these 36 studies, a total of 61 genes were curated, of which 26 genes (43%) were found to have modulation by estrogen. All 26 were discovered in studies that adjusted for sex. 12/26 genes were also discovered in studies that conducted sex-stratified analyses. 12/26 genes were classified as having a role in lipid synthesis, metabolism and/or lipoprotein mechanisms, while 11/26 were classified as having a role in vascular integrity, and 3/26 were classified as having a role in thrombosis. Discussion: This study provides further evidence of the relationship between estrogen, genetic risk and the development of CAD. More sex-stratified research will need to be conducted to further characterize estrogen's relation to sex differences in the pathology and progression of CAD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,011 | 0,032 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,004 |
| Bibliométrie | 0,015 | 0,022 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».