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Enregistrement W4408685695 · doi:10.1186/s12864-025-11397-0

Altered structural and transporter-related gene expression patterns in the placenta play a role in fetal demise during Porcine reproductive and respiratory syndrome virus infection

2025· article· en· W4408685695 sur OpenAlexafffund
Angelica Van Goor, J. Alex Pasternak, Kristen Walker, Shannon Chick, John C. S. Harding, Joan K. Lunney

Notice bibliographique

RevueBMC Genomics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesAgricultural Research ServiceGenome PrairieGenome AlbertaGenome Canada
Mots-clésFetusBiologyPlacentaAndrologyDownregulation and upregulationImmunologyCell biologyGenePregnancyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) can be transmitted across the maternal-fetal-interface from an infected gilt to her fetuses. Although fetal infection status and disease outcomes vary, the mechanisms are not completely understood. The objective was to assess targeted placental structural and transporter-related gene expression patterns. At day 85 of gestation pregnant pigs were challenged with PRRSV, and at 12 days post maternal infection sows and fetuses were sacrificed, and the placental tissue was collected. Grouping of fetuses was by preservation status and PRRS viral load (VL): control (CTRL, n = 14), viable and low VL fetus (VIA_LVF, n = 15), viable and high VL fetus (VIA_HVF, n = 21), meconium mild and low VL fetus (MECm_LVF, n = 14), meconium mild and high VL fetus (MECm_HVF, n = 14), and meconium severe and high VL fetus (MECs_HVF, n = 13). NanoString was used to evaluate the expression of 86 genes: actin cytoskeleton signaling, arachidonic acid pathway, integrin signaling, intercellular junctions, transporters, and VEGF signaling. Statistical analyses were performed using Limma with P ≤ 0.05 considered significant. RESULTS: We identified 1, 7, 0, 29, and 39 differentially expressed genes in VIA_LVF, VIA_HVF, MECm_LVF, MECm_HVF, and MECs_HVF, respectively, contrasted to CTRL. Placental transporter genes were significantly impacted (i.e., downregulation of SLC1A3, SLC1A5, SLC2A1, SLC2A3, SLC2A5, SLC2A10, SLC2A12, SLC7A4, SLC16A5, SLC16A10, and SLC27A6; and upregulation of SLC2A2, SLC16A3, and SLC27A4), compared to CTRL. Actin cytoskeleton signaling (ARHGEF6 and ARHGEF7), arachidonic acid (PTGES3 and PTGIS), integrin signaling (FN1 and ITGB6), intercellular junctions (CDH3 and CDH11), and VEGF signaling (MAPK3 and HPSE) gene groupings were significantly impacted, compared to CTRL. CONCLUSION: Data reported here indicate that fetal PRRSV infection levels rather than fetal demise is necessary for transcriptional dysregulation of the fetal placenta, with a tendency towards more downregulation in the target gene sets among susceptible fetuses. These results generally support that in susceptible fetuses there is altered solute transportation, placental structural integrity, and reduced angiogenesis. The data described here is associated with fetal PRRS resistance/resilience and susceptibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,355
Score d'incertitude au seuil0,772

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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