Structure of Mycobacterial NDH-2 Bound to a 2-Mercapto-Quinazolinone Inhibitor
Notice bibliographique
Résumé
Mycobacterial type II NADH dehydrogenase (NDH-2) is a promising drug target because of its central role in energy metabolism in Mycobacterium tuberculosis and other pathogens, and because it lacks a known mammalian homologue. To facilitate optimization of lead compounds, we used electron cryomicroscopy (cryo-EM) to determine the structure of NDH-2 from Mycobacterium smegmatis, a fast-growing nonpathogenic model for respiration in M. tuberculosis . The structure shows that active mycobacterial NDH-2 is dimeric, with an arrangement of monomers in the dimer that differs from the arrangement described for other prokaryotic NDH-2 dimers, instead resembling dimers formed by NDH-2 in the eukaryotes Saccharomyces cerevisiae and Plasmodium falciparum . A structure of the enzyme bound to a 2-mercapto-quinazolinone inhibitor shows that the compound interacts directly with the flavin adenine dinucleotide cofactor, blocking the menaquinone-reducing site. These results reveal structural elements of NDH-2 that could be used to design specific inhibitors of the mycobacterial enzyme.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».