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Enregistrement W4408722643 · doi:10.1021/acs.jafc.4c12704

Characterization of Phosphatidylcholine:Diacylglycerol Cholinephosphotransferases from Soybean (<i>Glycine max</i>)

2025· article· en· W4408722643 sur OpenAlexaff
Brandon A Ulch, Alyssa C. Clews, Monika Jesionowska, Matthew S. Kimber, Robert T. Mullen, Yang Xu

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural and Food Chemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiacylglycerol kinaseGlycineChemistryPhosphatidylcholineCharacterization (materials science)BiochemistryPhospholipidEnzymeAmino acidMaterials scienceNanotechnologyMembraneProtein kinase C

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plant oils in the form of triacylglycerols (TAGs) have important food and industrial applications. The fatty acid composition of TAGs, especially their degree of unsaturation, affects the oil value and applications. Phosphatidylcholine:Diacylglycerol Cholinephosphotransferase (PDCT) facilitates the exchange of fatty acids between phosphatidylcholine and diacylglycerol, influencing the degree of fatty acid unsaturation. In this study, we identified and characterized two PDCT isoforms from soybean ( Glycine max ). Phylogenetic and structural analyses revealed that PDCTs are widely conserved across Embryophyta and share key sequence and structural features among species. Subcellular localization assays using transient expression of fluorescent protein-tagged GmPDCTs in Nicotiana benthamiana leaves confirmed their localization to the endoplasmic reticulum. Expression of GmPDCT s in yeast altered lipid unsaturation, while in vitro enzyme assays using yeast microsomal fractions confirmed that both GmPDCTs are catalytically active, preferring unsaturated substrates. Further structural analysis and mutagenesis revealed that the N-terminus and several amino acids within/near the predicted catalytic domains are critical to the PDCT function. Lastly, stable overexpression of GmPDCT s in Arabidopsis thaliana rod1 ( pdct ) mutant plants successfully restored a wildtype lipid phenotype, providing evidence that these genes encode functional PDCTs. Together, these findings provide new insights into PDCT structure–function relationships, offering potential targets for bioengineering strategies aimed at optimizing oil composition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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