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Enregistrement W4408742001 · doi:10.1101/2025.03.19.644242

Genetic analysis of pigment production in the fungus <i>Exophiala dermatitidis</i>

2025· preprint· en· W4408742001 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolism and Applications
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFungusBiologyMicrobiologyPigmentBotanyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Exophiala dermatitidis is a polyextremotolerant black yeast species. E. dermatitidis produces 1,8 dihydroxynaphthalene (DHN) melanin via the Polyketide Synthase 1 ( PKS1 ) pathway enabling it to survive harmful conditions. This study focused on random mutagenesis to obtain albino ( alb ) and hyper-pigmented ( hyp ) mutants. Notably, all 17 alb mutants possessed mutations in PKS1 whereas the 133 hyper-pigmented ( hyp) mutants harbored mutations impacting a range of functions. Cell morphology and phenotypic assays showed additional differences between the alb and hyp mutants. Strikingly, three of the albino mutants ( alb1 , alb2 , and alb3 ) were conditional in that despite the presence of mutations in PKS1 they were able to produce melanin upon exposure to different carbon sources. These mutants otherwise shared similar cell morphology and growth patterns with the obligate albinos. No additional shared mutations were found among the conditional albinos. Temperature and UV irradiation assays demonstrated reduced growth of albino mutants at higher temperatures (i.e., 42°C) and a greater sensitivity to higher doses of UV. Single nucleotide variant (SNVs) calling showed that hyper-pigmented mutants had a greater number of SNVs compared to albino strains. To date this is the first study to generate and characterize conditional albino mutants in E. dermatitidis with the ability to recover melanin production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,332
Score d'incertitude au seuil0,969

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle