Natural human tRNA<sup>Ala</sup>anticodon variants mistranslate the genetic code
Notice bibliographique
Résumé
Transfer RNAs (tRNAs) play an essential role in protein synthesis by linking the nucleic acid sequences of gene products to the amino acid sequences of proteins. There are >400 functional tRNA genes in humans, and adding to this diversity, there are many single-nucleotide polymorphisms in tRNAs across our population, including anticodon variants that mistranslate the genetic code. In human genomes, we identified three rare alanine tRNA (tRNA Ala ) variants with nonsynonymous anticodon mutations: tRNA Ala CGC G35T, tRNA Ala UGC G35A, and tRNA Ala AGC C36T. Since alanyl-tRNA synthetase (AlaRS) does not recognize the anticodon, we hypothesized that these tRNA Ala variants will misincorporate Ala at glutamate (Glu), valine (Val), and threonine (Thr) codons, respectively. We found that expressing the naturally occurring tRNA Ala variants in human cells led to defects in protein production without a substantial impact on cell growth. Using mass spectrometry, we confirmed and estimated Ala misincorporation levels at Glu (0.7%), Val (5%), and Thr (0.1%) codons. Although Ala misincorporation was higher at Val codons, cells misincorporating Ala at Glu codons had the most severe defect in protein production. The data demonstrate the ability of natural human tRNA Ala variants to generate mistranslation, leading to defects in protein production that depend on the nature of the amino acid replacement.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».