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Enregistrement W4408750605 · doi:10.1002/pbc.31668

Amino Acid Stress Response Genes Contribute to a 25‐Fold Increased Risk of L‐Asparaginase–Induced Hypersensitivity

2025· article· en· W4408750605 sur OpenAlexafffund
Spencer J. Anderson, Erika N. Scott, Edward J. Raack, Wan‐Chun Chang, Miguel Córdova‐Delgado, Jessica N. Trueman, Catrina M. Loucks, Shahrad R. Rassekh, Colin J.D. Ross, Bruce Carleton

Notice bibliographique

RevuePediatric Blood & Cancer · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Lymphoblastic Leukemia research
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesProvincial Health Services AuthorityCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaGenome British ColumbiaGenome Canada
Mots-clésMedicineCohortOdds ratioIncidence (geometry)Internal medicineConfidence intervalAsparaginaseCumulative incidenceGastroenterologyOncologyLeukemiaLymphoblastic Leukemia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background L‐asparaginase is essential in treating pediatric acute lymphoblastic leukemia (ALL) but is limited by hypersensitivity reactions in up to 70% of patients, leading to severe, dose‐limiting complications and compromised event‐free survival. Procedure This study conducted a genome‐wide association study (GWAS) in a discovery cohort of 221 pediatric cancer patients who experienced l‐asparaginase–induced hypersensitivity reactions (≥CTCAE grade 2) and 705 controls without hypersensitivity despite equivalent exposure. Results were replicated in an independent cohort of 41 cases and 139 controls. Results Significant associations were identified between hypersensitivity and four genes crucial for amino acid stress response: CYP1B1 (rs59569490; odds ratio [OR] = 8.5; 95% confidence interval [CI], 3.9–18.5; p = 1.5 × 10−10), SEC16B (rs115461320; OR = 4.2; 95% CI, 2.5–7.9; p = 1.2 × 10−6), OPLAH (rs11993268; OR = 4.8; 95% CI, 2.4–9.9; p = 2.0 × 10−6), and SORCS2 (rs11940340; OR = 6.7; 95% CI, 2.8–15.7; p = 5.7 × 10−7). Variants in SEC16B, OPLAH, and SORCS2 remained significant in the analysis of the replication cohort (p < 0.05). Patients who carried risk alleles in two or more of these genes experienced an 86.4% increased incidence of hypersensitivity reactions in the discovery cohort (OR = 25.2; 95% CI, 7.4–86.2; p = 1.0 × 10−10), which was replicated in the independent cohort with a 100% incidence in carriers (p = 0.04). Conclusions The cumulative incidence of these large effect variants highlights their significance for the identification of patients at high risk of l‐asparaginase–induced hypersensitivity. Successfully identifying patients at increased risk of hypersensitivity reactions can inform personalized treatment strategies and limit these harmful dose‐limiting reactions in pediatric ALL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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