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Enregistrement W4408765751 · doi:10.1101/2025.03.21.644632

You Only Look Once (YOLO) Based Machine Learning Algorithm for Real-Time Detection of Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Diagnostics

2025· preprint· en· W4408765751 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueMachine Learning in Materials Science
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLoop-mediated isothermal amplificationLoop (graph theory)Isothermal processComputer scienceAlgorithmArtificial intelligencePhysicsMathematicsChemistryThermodynamics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a widely used rapid and affordable molecular DNA amplification method with minimal resource requirements. However, visual interpretation of results is subjective and prone to errors, leading to potential false-positive and negative results. To address this limitation, a machine-learning approach is proposed for automated LAMP classification based on digital images. The approach utilizes You Only Look Once (YOLOv8), a fast and robust object detection algorithm to locate and classify tubes within LAMP images, enabling automated categorization as positive or negative. The trained model achieved a high overall accuracy of 95.5% in classifying LAMP images into positive or negative. Additionally, the approach had a 98.0% precision and 92.7% recall for positive cases and 93.4% precision and 98.2% recall for negative cases, demonstrating its potential for real-time LAMP diagnosis and enhanced assay performance. This project demonstrated the platform’s suitability for real-time testing, offering an easy operation and rapid results.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,262
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle