The association of NLRP3 polymorphisms and its downstream interaction in mild cognitive impairment
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Nucleotide-binding domain and leucine-rich repeat (LRR)-containing family protein 3 (NLRP3) has been widely studied in the pathogenesis of mild cognitive impairments (MCI) and Alzheimer’s Disease (AD). Single nucleotide polymorphisms (SNPs) of NLRP3 gene are associated with various diseases, however the association between NLRP3 SNPs and downstream pathway is unclear. Methods 12 intron SNPs and 2 exon SNPs were genotyped in 235 normal controls and 331 MCI older adults. NLRP3 and other inflammation-related genes expression were quantified in peripheral blood mononuclear cells (PBMC) from the older adults by quantitative PCR (qPCR). Functional studies of selected mutations were performed by luciferase assay. The older adults were followed up for 2 years to investigate the relationship between NLRP3 SNPs and risk of cognitive decline. Results Our study showed rs10754558 and rs7525979 were associated with an increased risk of MCI. The T allele of rs12564791 was associated with higher gene expression level of NLRP3, interleukin-18 (IL-18), PYCARD, and CASP1. rs12048215, rs10754555, and rs7525979 were associated with cognitive decline as shown by the reduction of Montreal Cognitive Assessment (MoCA) score. Functional studies showed that both rs10754558 and rs10754555 G to C mutation affected enhancer activity of transcription. rs10754558 G to C mutation also disturbed the interaction between NLRP3 3’UTR and miR-425-5p. Plasma miR-425-5p expression was negatively correlated with MoCA score. Conclusions Our study suggested that genetic variations of NLRP3 were associated with the cognitive decline by affecting the gene expression of inflammation-related genes and its interactions to miRNAs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».