Actionable Mutations and Survival Rates in Non-Small Cell Lung Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Background: In Jordan, lung cancer ranks as the second most common tumor, and there is an urgent need to explore the genetic landscape of lung cancer. This study aimed to identify the actionable mutations in lung cancer samples in Jordanians by targeted next-generation sequencing (NGS) and to investigate the correlations with clinical and pathological parameters. Methods: Totally, 121samples were prepared for NGS by DNA extractions from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) blocks, followed by library preparation using the AmpliSeq Colon and Lung panel, which covers mutational hot spot regions for 22 cancer genes. Results: ). There are no significant differences between actionable mutation carriers and non-carriers concerning histological tumor type, tumor stage, metastasis, smoking habits, and gender. However, the analysis of survival probabilities revealed lower survival times for females compared to males, as well as for those patients who had metastasis events, smoking, or relapse after treatment. Conclusions: The type and rates of mutations detected for lung tumors in Jordan are relatively similar to those found in other populations previously studied, although some differences exist. However, lung tumors in Jordan require new customized treatment prescriptions based on prior genetic studies, as part of the hoped-for trend toward precision medicine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».