Identification of a candidate rice blast resistance gene, <i>Pior4</i>(t), in an introgression line of <i>Oryza rufipogon</i> using CRISPR/Cas9-mediated genome editing
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Resistance breeding for rice blast is an economic strategy for protecting rice crops against this disease. Genes with nucleotide-binding site leucine-rich repeat (NBS-LRR) structures are known to contribute to disease resistance. Here, we identified a candidate resistance gene, named Pior4(t), associated with leaf and panicle blasts in an introgression line carrying the chromosome 4 segment of wild rice (Oryza rufipogon Griff.) backcrossed with the cultivar ‘Nipponbare’ (Oryza sativa L.). Mapping analysis based on leaf blast severity confirmed that Pior4(t) was localized in the 177-kb NBS-LRR cluster region. To identify the Pior4(t) sequence, mutant lines were generated by knocking out a candidate NBS-LRR gene in a homozygous line carrying Pior4(t), M18, using CRISPR/Cas9-mediated genome editing. Leaf blast resistance was lost in the mutant lines lacking the corresponding Os04g0620950 N-terminal sequence of the M18 line. The result suggested that the counterpart NBS-LRR gene in the M18 line is involved in resistance to leaf blast. Pior4(t) showed homology to Pi63 in the resistant cultivar ‘Kahei’, and an NBS-LRR gene in the resistant cultivar ‘Mine-haruka’ carrying Pi39(t). These results suggest that the NBS-LRR gene is a candidate gene of Pior4(t) and is present on the long arm of chromosome 4.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle